Seurat 是 R 语言生态中最核心的单细胞基因组学分析工具包，由 Satija 实验室开发并维护。最新发布的 Seurat v5 版本在空间转录组、多模态数据整合以及大规模单细胞数据分析方面引入了重要更新，同时保持与旧版本的向后兼容性。Seurat 提供了从数据质控、标准化、降维、聚类到差异表达分析、细胞类型注释的完整工作流，并支持与 Harmony、LIGER 等多种整合算法的无缝对接。其丰富的可视化功能和活跃的社区生态使其成为单细胞转录组数据分析的事实标准。