fastp 是一款超高速的 FASTQ 数据预处理和质量控制一体化工具。它能够在单次运行中完成多项任务,包括:自动识别和切除接头序列、低质量碱基过滤、长度过滤、低复杂度序列过滤、碱基校正(针对双端数据)、polyG/polyX 尾修剪等。fastp 支持批量处理多个 FASTQ 文件,并提供详细的 HTML 格式质控报告。与传统的多工具串联工作流(如 Trimmomatic + FastQC)相比,fastp 在保证处理质量的同时大幅提升了运行速度,是 RNA-seq 数据预处理的首选工具之一。