pheatmap 是 R 语言中用于绘制漂亮热图的专用包。它解决了 R 基础热图函数在生成出版级热图时的诸多不足，如图形尺寸、文字和单元格大小的一致性控制等问题。pheatmap 提供了精细的图形控制选项，包括：直接控制单元格大小和文字尺寸、自动生成图例、行和列注释、基于 grid 图形系统的后期编辑能力、使用间隔符对聚类进行视觉分割等。该工具以其简单易用和输出美观而广受欢迎，是转录组表达矩阵可视化的常用工具。