GEMMA是基因组范围高效混合模型关联分析的软件工具包。其核心功能包括：基于单变量线性混合模型（LMM）的快速关联检验（校正群体结构和样本不可交换性）、基于多变量线性混合模型（mvLMM）的多表型联合关联检验、以及贝叶斯稀疏线性混合模型（BSLMM）用于估计遗传力和预测。GEMMA 还提供 SNP 遗传力（"芯片遗传力"）的估计功能。目前 GEMMA 的主要开发已迁移至 PanGEMMA 项目。