Yunnan Key Laboratory of Biological Big Data · 云南省生物大数据重点实验室
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27 门课程

ATAC/CUT&Tag基础培训2
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ATAC/CUT&Tag基础培训2

本课程系统介绍ATAC‑seq技术原理、实验流程及生物信息学分析方法,涵盖染色质可及性检测、peak鉴定、差异开放区域分析、motif预测及功能富集,并对比CUT&Tag、DNase‑seq等技术,阐述其在转录调控和表观遗传研究中的重要应用。

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转录组分析1

本课程系统讲授转录组RNA‑Seq数据分析全流程,涵盖测序原理、质控、定量(RPKM/FPKM/TPM)、差异分析(Ballgown/DESeq2/edgeR)及可视化(火山图、韦恩图、热图、WGCNA),提供完整实操代码与工具指南。

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转录组分析2
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转录组分析2

本课程系统讲授转录组RNA‑Seq数据分析全流程,涵盖测序原理、质控、定量(RPKM/FPKM/TPM)、差异分析(Ballgown/DESeq2/edgeR)及可视化(火山图、韦恩图、热图、WGCNA),提供完整实操代码与工具指南。

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R基础培训1

本课程系统介绍R语言基础与生物信息学应用,涵盖软件安装、包管理、核心数据结构、文件读写及ggplot2绘图,为统计计算与数据可视化奠定坚实入门基础。

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R基础培训2
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R基础培训2

本课程系统介绍R语言基础与生物信息学应用,涵盖软件安装、包管理、核心数据结构、文件读写及ggplot2绘图,为统计计算与数据可视化奠定坚实入门基础。

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单细胞基础理论
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单细胞基础理论

本课程系统介绍单细胞转录组测序技术原理、10X平台流程、基础分析(质控、聚类、注释)及高级分析(整合校正、通讯、拟时序、CNV),涵盖植物研究现状与实用工具。

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空间转录组
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空间转录组

本课程系统介绍10X Visium空间转录组技术原理、基础分析流程(数据定量、标准化、降维聚类)、细胞类型注释(结合单细胞数据反卷积)及多样本整合策略,涵盖动植物研究案例。

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基因组学
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基因组学

本课程系统讲解基因组从头组装与注释全流程,涵盖调研图(K‑mer评估)、组装策略与评估(N50、BUSCO、LAI)、重复序列与基因结构注释、功能注释,以及Hi‑C三维基因组(A/B区室、TAD、环)的构建与应用。

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基因组与三维基因组2
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基因组与三维基因组2

本课程系统讲解基因组与三维基因组分析流程,涵盖调研图(K‑mer评估)、基因组组装(Hifiasm/3D‑DNA/ALLHiC)、质量评估(BUSCO/Merqury/LAI)、注释(EDTA/GeMoMa)及Hi‑C互作(质控、A/B区室、TAD、Loop),提供完整实操指南。

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基因组与三维基因组1
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基因组与三维基因组1

本课程系统讲解基因组与三维基因组分析流程,涵盖调研图(K‑mer评估)、基因组组装(Hifiasm/3D‑DNA/ALLHiC)、质量评估(BUSCO/Merqury/LAI)、注释(EDTA/GeMoMa)及Hi‑C互作(质控、A/B区室、TAD、Loop),提供完整实操指南。

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基因组重测序分析1
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基因组重测序分析1

本课程系统讲解基因组重测序分析流程,涵盖原理、BWA比对、GATK变异检测与质控、snpEff注释统计及结构变异(SV)检测,为群体遗传与分子育种研究提供完整实操方案。

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基因组重测序分析2
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基因组重测序分析2

本课程系统讲解基因组重测序分析流程,涵盖原理、BWA比对、GATK变异检测与质控、snpEff注释统计及结构变异(SV)检测,为群体遗传与分子育种研究提供完整实操方案。

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