1、目前，云南省生物大数据重点实验室已经构建了多个通用类数据库，包括：
a、家鸡数据库
b、山茶科数据库
c、人参属数据库
d、药用植物数据库（版本1和版本2）
e、葡萄属数据库
f、此外，还建立了以下专项数据库：
g、珍珠鸡数据库
h、番鸭数据库
i、蔗茅数据库
j、海南大叶茶数据库
k、实验动物基因组编辑数据库
l、多酚类合成通路及关键酶数据库
m、以及商业数据库：
n、中国普洱茶大数据中心
并设有：
云南省生物大数据重点实验室生物多组学数据库中心导航数据库。目前共计14个数据库。这些数据库均部署在云南省生物大数据重点实验室数据中心的202.203.179.160 和 202.203.179.161 两台服务器上。截至目前，累计访问量已达到130万人次，访问用户来自685个国家和地区。项目已经在多家国际重要期刊上发表，包括MolecularPlant、PlantBiotechnology Journal、Plant Communications、Frontiers in Plant Science、Database 等。项目共获得6项软件著作权。

2.具体信息--通用类数据库
2.1 Chicken2K 家鸡数据库（未发表）
家鸡数据库包含188个品种、共计1984份来自全球不同地区的全基因组重测序数据和群体信息，汇总了8000多万变异信息和遗传图谱，还包括相关领域文章发表信息的检索数据和多个在线分析工具。目前，相关论文正在投稿中。数据总量约30TB，形成了家禽领域迄今为止数据量最大的遗传数据集合，清晰勾勒了家鸡的驯化历史，并挖掘了大量与家鸡驯化相关的基因。这些数据都汇集在云南省生物大数据重点实验室的家鸡基因组数据库中（http://chicken.ynau.edu.cn/index/home/index）。该数据库已经开放给同行专家使用，并获得了热烈的好评，是我国在家禽育种方面的重要数据贡献和数据资源。
2.2 Teabase 茶叶数据库（PlantCommunications）
茶叶数据库包含8个基因组组装数据、700个全球重测序数据、400份转录组数据、1500份云县茶叶数据、1个泛基因组、400个宏基因组数据、3个遗传图谱，同时还整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库。数据总量约100TB。
2.3 VitisGDB 葡萄数据库（Molecularplant）
实 验 室 构建了首个葡萄属植物基因组学网站 VitisGDB（http://vitisgdb.ynau.edu.cn/）。数据库共收录了葡萄属 7 个物种共 22 个基因组组装结果，处理了1641个重测序数据及相应的表型信息，预测鉴定出9395万个单核苷酸变异位点（SNP）及9.7万个基因共线性关系。通过整合多种可视化组件与基因组在线比较工具，这个数据库将不同类型的数据有机整合在一起，为用户提供了友好的数据检索、下载和在线分析服务。该数据库在国际同行评议中获得了高度评价，被认为是葡萄遗传资源领域中最全面和易用的数据库之一。数据总量约200TB。
2.4 HMOD药用植物数据库1（Molecularplant）药 用 植 物 组 学 数 据 库 “Herbal Medicine Omics Database”（http://herbalplant.ynau.edu.cn/）整合了 23 个药用植物基因组数据、172 个药用植物转录组数据、55个药用植物代谢组数据以及18个代谢通路信息。
2.5 MPOD药用植物数据库2（Plantbiotechnologyjournal）
药食同源植物数据库（Medical and edible plant databae, MEPD ，http://212.64.51.94:8023/）累计包括 140 个药食同源物种的基因组信息，和200多个转录组信息、超过500个化合物的信息，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库，是目前最全最大的药食同源植物数据库。数据总量约为30TB。
2.6 PanaxGDB 人参属数据库（Frontiersin plant science）
人参属数据库包括4个参考基因组，750个皂苷化学式和蛋白结构式、330份转录组数据、260份重测序数据，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库。数据总量约10TB。

3.具体信息—专项类数据库
3.1. HGFDB 珍珠鸡数据库（Database）
珍珠鸡数据库包含1个参考基因组、20个转录组、200份重测序数据，并整合
了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同
构建了功能强大的后台数据库。数据总量约10TB。
3.2 番鸭数据库（未发表）
番鸭数据库包含1个参考基因组、10份转录组数据、200份重测序数据，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库。数据总量约10TB。
3.3 蔗茅数据库（Database）
蔗茅数据库包含1个参考基因组、20份转录组数据、252份重测序数据，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库。数据总量约10TB。
3.4 海南大叶茶数据库
海南大叶茶数据库主要面向种质资源、生物多组学和产业大数据，整合了丰富的茶叶种质资源信息、基因组和转录组数据，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具。该数据库不仅为科研人员提供了便捷的工具以解析和挖掘数据，还支持产业数据的整合和分析，促进了海南大叶茶的科研和产业发展。
3.5 实验动物基因组编辑数据库（未发表）
实验动物基因组编辑数据库包含10个参考基因组、200份转录组数据、1000份重测序数据，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库。数据总量约10TB。
3.6 多酚类合成通路及关键酶数据库（未发表）
多酚类合成通路及关键酶数据库包含100个多酚合成通路、65个关键酶的基因数据、以及265个代表物种基因组中的分布情况，并整合了相关领域发表的文章信息检索数据以及丰富的在线分析工具和可视化工具，共同构建了功能强大的后台数据库。数据总量约为1TB。

4.具体情况—其他
4.1 中国普洱茶大数据中心等商业数据库
2019 年，云南省生物大数据重点实验室联合官渡区政府、云南省林业厅、浪潮集团搭建“中国普洱茶大数据中心”（ http://39.129.96.75:19401/），将生产数据和消费数据整合为一体，并将古茶树资源进行了点对点式的定位，累计收集古茶树、古茶园3000多条信息，品牌和生产信息2400多个，普洱茶商品28万个，形成普洱茶生产、消费的数据中心。
4.2 云南省生物大数据重点实验室生物多组学数据库中心导航数据库
云南省生物大数据重点实验室生物多组学数据库中心导航数据库提供了所有数据库的访问入口和导航服务