长读长测序结合 Hi-C 拆分 4 套同源染色体单倍型,转录代谢组解析休眠解除、果实抗病相关通路。
主要发现:
成功拆分四倍体樱桃 4 套单倍型基因组,组装完整度达 98.60%;
阐明 NBS-LRR 抗病基因扩张是樱桃属广谱抗病核心遗传基础;
挖掘调控冬季芽休眠释放的关键脱落酸 / 赤霉素通路基因;
筛选改良果实硬度、抗病性的分子标记支撑樱桃育种;
相关文献 Haplotype-resolved genome assembly for tetraploid Chinese cherry (Prunus pseudocerasus) offers insights into fruit firmness, evolution and dormancy release 发表于《Horticulture Research》(IF:7.3)。
研究进展
微花樱基因组解析樱桃属进化、抗病与休眠释放
👤 Jiu Songtao, Lv Zhengxin, Liu Moyang(Dong Yang#)
📅 七月 08, 2024
📍 Horticulture Research
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Summary:摘要:完成四倍体中国樱桃(微花樱)单倍型拆分染色体基因组组装,解析樱桃属物种分化、抗病基因进化与芽休眠调控分子机理
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https://academic.oup.com/hr/article/doi/10.1093/hr/uhae142 →