课程目标

本课程面向生物学/医学背景的学生和研究人员，无需任何编程基础。

完成本课程后你将能够：

  • 独立阅读和编写中等复杂度的 Python 脚本
  • 使用 Biopython 处理 FASTA / GenBank / PDB 等常见生物数据格式
  • 用 pandas 进行数据清洗和统计
  • 自动化日常工作流（批量下载、批量 BLAST、批量转换格式）

课程大纲

  1. 第 1 讲：为什么 Python？安装与运行（30 min）
  2. 第 2 讲：变量、数据类型、控制流（45 min）
  3. 第 3 讲：函数、模块、文件读写（45 min）
  4. 第 4 讲：正则表达式与字符串处理（30 min）
  5. 第 5 讲：Biopython 入门（60 min）
  6. 第 6 讲：pandas 数据分析（60 min）
  7. 第 7 讲：实战：批量下载 NCBI 数据（45 min）
  8. 第 8 讲：调试、错误处理与最佳实践（30 min）

预备知识

  • 高中生物水平即可
  • 不需要任何编程经验
  • 建议有一台能装 Python 3.10+ 的电脑