适合对象
已掌握基础生物信息学概念(序列比对、变异检测),想深入群体基因组学方向的研究生和科研人员。
核心内容
- 第 1-2 章:群体遗传学基础(HW 平衡、LD、群体结构)
- 第 3-4 章:SNP calling 与过滤(GATK best practices)
- 第 5-6 章:群体结构与 PCA、ADMIXTURE
- 第 7-8 章:选择信号检测(Tajima's D, FST, PBS, XP-EHH, iHS)
- 第 9-10 章:PSMC / MSMC / SMC++ 群体历史推断
- 第 11-12 章:GWAS 与 eQTL