依托 PacBio 长读长测序联合 Hi-C 挂载染色体,系统开展共线性分析、基因家族进化与系统发育重构。
主要发现:
1.证实唇形目祖先经历一次古老全基因组加倍事件,不同演化分支后续发生差异化染色体断裂融合;
2.解析寄生类群与自养型唇形目植物基因家族得失、功能分化模式;
3.完善唇形目高精度系统发育框架,为本目药用、经济林木的演化解析与种质开发提供基础基因组资源。
相关文献 Chromosome-level assembly of Lindenbergia philippensis and comparative genomic analyses shed light on genome evolution in Lamiales 发表于《Frontiers in Plant Science》(IF:5.87)。
研究进展
菲律宾石梓染色体水平基因组组装及唇形目比较基因组解析
👤 Bao-Zheng Chen,Da-Wei Li,Kai-Yong Luo(董扬 #)
📅 2024 年 08 月 02 日
📍 Frontiers in Plant Science
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摘要:构建菲律宾石梓高质量染色体参考基因组,结合多份唇形目代表性物种开展比较基因组分析,解析唇形目物种全基因组加倍事件、核型重塑与物种分化演化规律。