整合三代长读测序与 Hi-C 实现染色体锚定,结合转录组数据完善基因模型注释,开展近缘物种比较基因组分析。
主要发现:
1.组装得到 13 条完整染色体基因组,精准注释三万余个蛋白编码基因;
2.定位白饭树特征性木脂素、药用生物碱合成关键扩张酶基因家族;
3.厘清大戟科物种染色体演化重排规律,为白饭树药用成分开发、种质资源评价提供可靠基因组数据支撑。
相关文献 Chromosome-level genome assembly and annotation of Flueggea virosa (Phyllanthaceae) 发表于《Scientific Data》(IF:8.9)。
研究进展
白饭树染色体水平基因组组装与功能注释
👤 Bao-Zheng Chen,Zi-Jiang Yang,Wei-Bin Wang(董扬 #)
📅 2024 年 11 月 08 日
📍 Scientific Data
👁 浏览 1
摘要:完成大戟科白饭树染色体级基因组组装与全套基因结构、功能注释,挖掘其生物碱、黄酮等药用活性物质合成通路关键基因,解析大戟科典型基因组进化特征。