利用 PacBio 测序结合 Hi-C 技术完成染色体级别基因组组装,对比正常肝脏与脂肪肝样本转录组差异筛选易感基因。
主要发现:
获得染色体挂载完整度高的番鸭高质量参考基因组;
鉴定出脂质沉积、炎症调控相关差异基因,揭示番鸭耐受脂肪肝损伤的独特基因组特征;
为水禽脂肪肝代谢育种、禽类脂肪代谢研究提供基因组基础;
相关文献 Chromosome-level genome assembly of the Muscovy duck provides insight into fatty liver susceptibility 发表于《Genomics》(IF:5.736)。
研究进展
番鸭染色体基因组与脂肪肝易感机制
👤 Xu Minmin, Xu Tieshan, Dong Yang(Peng Minsheng#)
📅 2022 年 11 月 01 日
📍 Genomics
👁 浏览 1
摘要:摘要:组装染色体水平番鸭参考基因组,挖掘番鸭高脂饲喂诱导脂肪肝易感的关键遗传位点与调控通路