利用 PacBio HiFi 测序搭配 Hi-C 完成染色体挂载,结合群体分化分析筛选驯化受选择位点。
主要发现:
1.厘清桔梗目共有古老全基因组复制事件,明确党参物种独立演化进程中的染色体重排模式;
2.筛选党参多糖、三萜皂苷合成通路关键扩张基因家族;
3.定位人工驯化中品质、抗逆性状关联受选择基因位点,为道地党参良种选育、药材品质定向改良提供分子依据。
相关文献 Chromosome-scale genome assembly of Codonopsis pilosula and comparative genomic analyses shed light on its genome evolution 发表于《Frontiers in Plant Science》(IF:5.87)。