利用 PacBio HiFi 测序搭配 Hi-C 完成染色体挂载,结合群体分化分析筛选驯化受选择位点。
主要发现:
1.厘清桔梗目共有古老全基因组复制事件,明确党参物种独立演化进程中的染色体重排模式;
2.筛选党参多糖、三萜皂苷合成通路关键扩张基因家族;
3.定位人工驯化中品质、抗逆性状关联受选择基因位点,为道地党参良种选育、药材品质定向改良提供分子依据。
相关文献 Chromosome-scale genome assembly of Codonopsis pilosula and comparative genomic analyses shed light on its genome evolution 发表于《Frontiers in Plant Science》(IF:5.87)。
研究进展
党参染色体水平基因组组装及其基因组演化解析
👤 Bao-Zheng Chen,Zi-Jiang Yang,Ling Yang(董扬 #)
📅 2024 年 11 月 04 日
📍 Frontiers in Plant Science
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摘要:构建党参染色体级高质量参考基因组,借助共线性分析、Ks 分化曲线追溯其古多倍化历史,解析党参多糖、三萜皂苷等标志性药用活性成分形成的遗传基础。