完成 AB 品系高质量基因组组装,与已发布 Tuebingen 参考基因组开展全基因组序列结构变异比较分析。
主要发现:
两个主流斑马鱼实验品系基因组间存在大量结构变异与序列分化;
揭示长期实验室人工繁育造成斑马鱼亚群遗传分化的基因组特征;
提醒发育、药理实验中品系基因组差异会干扰实验结果重复性;
相关文献 Extensive sequence divergence between the reference genomes of two zebrafish strains, Tuebingen and AB 发表于《Molecular Ecology Resources》(IF:7.7)。
研究进展
两种斑马鱼参考基因组序列分化
👤 Deng Yu, Qian Yuting, Meng Minghui(Yang Liandong#)
📅 2022 年 02 月 21 日
📍 Molecular Ecology Resources
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摘要:摘要:对比 Tuebingen、AB 两大实验室常用斑马鱼品系参考基因组,解析品系间大范围结构变异与序列分化程度